Ученые составили самый подробный атлас генетики овец за 10 тысяч лет
Международная группа ученых, включая исследователей из Орхусского университета, создала SheepGTEx — самый полный на сегодняшний день атлас того, как генетические вариации влияют на регуляцию генов у овец. Изучив 51 тип тканей и клеток, они выявили сотни тысяч регуляторных эффектов и нашли новые следы одомашнивания в ДНК животных. Об этом рассказывает издание Phys.org.
Атлас объединил данные 6 761 образцов РНК от 2 816 овец и ДНК 52 древних животных возрастом около 10 тысяч лет. Исследователи обнаружили, что отбор по шерсти, размеру и репродуктивным качествам менял не только последовательности ДНК, но и механизмы, управляющие активностью генов. Особенно их удивило, что варианты, действующие в одной или нескольких тканях, несли более сильные следы отбора, чем те, что влияют на многие ткани сразу.
Один из примеров — ген THNSL2, активность которого в коже связана с генетическими вариантами. Его вариант, повышающий активность у современных овец, становился все более распространенным среди европейских овец от неолита до Средневековья, хотя его частота колебалась. Поскольку шерсть растет из волосяных фолликулов в коже, это указывает на возможную связь между регуляцией генов и эволюцией шерстяных признаков, хотя прямого влияния на производство шерсти ученые не установили.
Атлас также помог найти генетическую ассоциацию с регуляцией гена FXYD1 в передней доле гипофиза — ткани, важной для размножения. Это дает конкретную гипотезу о механизмах, влияющих на размер помета, которую теперь можно проверить экспериментально. Исследование опубликовано в журнале Nature Genetics.
По словам доцента Линчжао Фана из Орхусского университета, атлас дает прочную основу для поиска вариантов, заслуживающих дальнейшего изучения, и в перспективе поможет создать более точные инструменты для селекции. SheepGTEX доступен публично, и ученые по всему миру могут использовать его для изучения биологии, эволюции и генетических признаков овец.
