Ученые создали ИИ-модель для быстрого дизайна белков и ферментов
Модель RFD4-Proteina, разработанная Институтом дизайна белков (IPD) совместно с NVIDIA, генерирует новые последовательности и структуры белков с эффективностью в 5-10 раз выше предыдущих моделей и в 5-10 раз быстрее. Это открывает путь к созданию ферментов для производства лекарств. Данную информацию сообщает портал Phys.org.
Исследователи из Манчестерского института биотехнологии вместе с IPD применили модель для дизайна новых ферментов, способных синтезировать ленакапавир — препарат для профилактики ВИЧ. Из 67 созданных конструкций четыре проявили активность, лучший вариант преобразовал 79% исходного соединения в нужный продукт. Фермент также показал высокую селективность, что критично для этого сложного синтеза.
Исследование опубликовано в виде препринта и служит доказательством концепции: новые ферменты можно создавать вычислительными методами для сложных этапов производства активных фармацевтических ингредиентов. Руководитель MIB Энтони Грин отметил впечатляющие результаты сотрудничества с командой IPD, подчеркнув, что модель быстро выдает новые биокатализаторы для терапевтических средств и других химических веществ.
RFD4-Proteina сочетает две существующие ИИ-модели (RosettaFold Diffusion от IPD и Proteina-Complexa от NVIDIA) и способна одновременно учитывать несколько аспектов структуры и функции белка. Модель доступна с открытым исходным кодом, что позволяет другим ученым использовать ее в своих исследованиях.
